安徽中医药大学前身为1952年创立的安徽省中医进修班。1959年，安徽省人民政府批准成立安徽中医学院。2011年，在安徽中医学院的基础上组建成立安徽省中医药科学院。2013年，教育部同意安徽中医学院更名为安徽中医药大学。2014年，获批安徽省地方特色高水平大学建设单位。2023年，列入安徽省“双一流”创建重点高校。学校是国家中医临床研究基地、国家中医药国际合作基地，博士授权单位、硕士研究生推荐免试单位。

学校现有少荃湖、梅山路、史河路、六安路四个校区，13个二级学院，32个本科专业，全日制学生近2万人，其中博士生190人，硕士生3269人）。教职工4000余人，其中副高以上职称人员近千人。

学校拥有国医大师、国家杰青、岐黄学者、全国名中医、全国黄大年式教师团队、国家万人计划教学名师、国家中医药高等学校教学名师，2个国家级教学团队，33个省级教学团队等一批高水平师资力量。现有博士生导师168人，硕士生导师1093人。

学校现有6个国家级一流本科专业建设点，10个省级一流本科专业建设点，14门国家级一流本科课程，2个国家级实验教学示范中心，1个国家级中医临床教学培训示范中心，1个国家级专业综合改革试点项目，2个国家级卓越医生（中医）教育培养计划。拥有3个一级学科及1个博士专业学位授权点，6个一级学科、26个二级学科及4个硕士专业学位授权点，3个博士后流动工作站，国家中医药管理局高水平中医药重点学科6个、重点学科17个，进入ESI全球排名前5‰和前1%学科各1个，安徽省Ⅱ类、Ⅲ类高峰学科各1个，安徽省重点学科13个，安徽省高峰培育学科4个。建有国家中医区域医疗中心1个，国家区域中医（专科）诊疗中心4个，国家临床重点专科9个，国家中医药管理局重点专科20个。

60余年来，学校为国家和地方输送优秀毕业生6万余人，近5年毕业生平均就业率94%。学校积极探索人才培养模式改革，“地方中医药院校高素质应用型药学类人才培养体系构建与实践”“院校-师承-地域医学教育相结合，培养新安医学特色的中医学人才研究与实践”分别获国家级教学成果二等奖。作为主要单位参与“以标准引领全球中医药教育—中医药教育标准的创建与实践”获国家级教学成果一等奖。学校获国家级A类赛事一等奖8项，荣获全国大中专学生志愿者暑期“三下乡”社会实践优秀单位、全国红十字模范单位、全国“七彩假期”志愿服务示范单位、全国大学生年度人物提名奖等荣誉称号。

学校大力推进科技强校战略，近5年来，共承担各级科研项目近2000项，其中国家级项目近200项；获省部级以上科技奖励68项，其中国家科学技术二等奖1项，省部级一等奖8项；建有50余个产学研合作基地。获“全国科技特派员工作先进集体”“中医药科技管理工作先进集体”“推动中医药学术发展特别贡献奖”等称号和荣誉。

学校注重提升医疗服务水平，建有3所直属附属医院、8所非直属附属医院和国医堂门诊部。第一附属医院是全省最大的三级甲等综合性中医医院；第二附属医院是全国首家也是规模最大的三级甲等针灸专科医院；2023年，获建安徽省首个国家中医区域医疗中心。

学校积极响应国家“一带一路”倡议，与20多个国家和地区的40多个医疗和教育机构建立了友好合作关系。在希腊设立安徽中医药大学雅典中医药中心。先后有10多个国家和地区的学员来校攻读博士、硕士、学士学位以及参加中短期培训。

目前，学校以“双一流”建设为抓手，以中医药学科为主体，统筹推进中医药学与理学、工学、管理学、经济学、文学类学科的协同发展，构建完善交叉融合、相互支撑、协调发展、特色鲜明的学科专业体系，努力建成国内有实力、省内高水平、行业有影响的中医药特色鲜明的地方高水平大学，为建设现代化美好安徽、服务人民大众健康和健康中国建设作出更大贡献。