学校现设有10个教学系部

1.临床医学系

2.护理学系

3.口腔医学系

4.药学与医学检验系 

5.医学技术系

6.健康管理系

7.中医药系

8.思想与政治理论教学部 

9.基础医学部

10.公共教学部

学校拥有13个实验实训教学中心，分别为：形态一实验教学中心、形态二实验教学中心、机能学实验教学中心、分析学实验教学中心、临床技能实验教学中心、护理技能实验教学中心、药学实验教学中心、康复治疗技术实训中心、口腔医学技能实训中心、中心实验室、中医实验教学中心、计算机实验教学中心、英语语音教学中心。

其中校级重点实验室3个：

1.临床技能实验室

2.护理技能实验室

3.中心实验室

中央财政支持重点建设专业--临床医学专业、护理专业

山东省特色专业--护理专业、助产专业、临床医学专业

山东省省级精品课程--《药理学》、《生理学》、《诊断学》、《生物化学》、《人体解剖学》、《病理学》、《基础护理学》、《护理心理学》、《内科护理学》、《外科护理学》、《内科学》、《外科学》、《妇产科学》、《儿科学》、《预防医学》、《麻醉解剖学》、《麻醉生理学》、《麻醉药理学》、《麻醉设备学》、《临床麻醉学》等3个省级精品课程群、29门省级精品课程。 

山东省教学试点课程--《药理学》、《诊断学》

校级重点学科：药理学、生理学、诊断学、生物化学、人体解剖学、病理学、内科学、外科学

山东省省级教学团队--药学专业教学团队、护理学、临床医学专业教学团队

学校具有一支师德高尚、业务精湛、经验丰富的师资队伍。现有专任教师616人，附属医院、行业一线兼任教师296人；专任教师中具有研究生学历的359人，占专任教师总数的58.28%；具有副高级专业技术以上职务的153人，占24.84%；“双师型”教师280人，占专任教师的45.45%，“名师名医”特色鲜明，有30余名学校专任教师是菏泽市医药卫生行业的学科带头人。拥有临床医学专业、护理专业、药学专业、医学检验技术4个省级教学团队，山东省教学名师、省级优秀教师15人，硕士研究生指导教师13人。

普通全日制在校生13673人。