学校学科门类较为齐全，涵盖经济学、法学、教育学、文学、理学、工学、农学、管理学、艺术学、交叉学科等10个学科门类。植物学与动物学、工程学、农业科学3个学科进入ESI全球前1%。现有一级学科博士学位授权点4个、一级学科硕士学位授权点15个、硕士专业学位授权点（类别）19个。拥有福建省一级重点学科8个（其中特色重点学科2个），水产、船舶与海洋工程2个博士后科研流动站。船舶与海洋工程、水产入选福建省“双一流”建设高校主干学科，船舶与海洋工程学科群、水产与食品工程学科群入选福建省高峰学科，航运与港口物流学科群、区域经济与管理学科群、闽台体育文化学科群、数理学科群入选福建省高原学科。

学校现有本科专业77个，其中国家级特色专业4个、国家级一流本科专业建设点25个、国家级“卓越”人才培养计划专业6个、国家级专业综合改革试点项目3个、教育部工程教育认证专业4个、教育部师范类专业第二级认证6个、省级一流专业建设点24个、省级特色专业建设点和省级专业综合改革试点各11个、省服务产业特色专业8个、省创新创业教育改革试点专业6个。拥有国家级教学团队1个、国家级实验教学示范中心2个、国家级虚拟仿真实验教学中心1个、国家级大学生校外实践教育基地1个、省级教学团队12个、省级实验教学示范中心16个、省级虚拟仿真实验教学中心4个。

按教育部有关规定，达到毕业要求的，由集美大学颁发经教育部电子注册的普通高等学校毕业证书；符合学位授予规定的，由集美大学授予学士学位。

学校现有专任教师1500人左右，拥有院士10人、国家级高层次人才36人次、省部级高层次人才283人次、市厅级高层次人才400人次。

学校设有20个学院，在校生30000多人，其中全日制本科生26700多人，研究生3100多人，国际学生近200人。