我校现有地理学、物理学、化学、生物学、生命科学与技术、历史学、大气科学、信息科学与技术（计算机科学、通信工程2个方向）、核科学与技术(原子核物理、放射化学2个方向)、理论与应用力学、草业科学、数学、经济学、管理学14个基础科学研究和教学人才培养基地（简称“基地班”）。

“基地班”主要为国家培养学科基础扎实、富于创新精神、知识面宽、能力强、综合素质高，有志于从事基础理论研究、应用研究和高层次教育事业的优秀人才。品学兼优者可直接进入硕士研究生阶段学习，两年后，可提前攻读博士学位。
为加强“基地班”人才培养，学校从2003年开始设立了“基础科学人才培养基金科学研究培训项目”（简称“基地科研培训项目”），每年拿出部分基地建设经费用于高年级学生的科研能力培训。立项项目同时纳入学生创新创业行动计划，对其中的优秀成果，推荐参加“挑战杯”等学生课外学术科技活动，并对项目完成人给予学分奖励等。同时，学校在原有奖学金的基础上设立了“基础科学人才培养基金奖学金”（简称“基地奖学金”），用于奖励基地班品学兼优的学生。

2010年部分“基地班”将采取部分计划进入招生过程、部分计划进校后选拔的办法。
全部计划进入招生过程的“基地班”有3个：理论与应用力学基地班、草业科学基地班、数学基地班

部分计划进入招生过程、部分计划进校后选拔的“基地班”有9个：历史学基地班、经济学基地班、管理学基地班、核科学与技术基地班（原子核物理及核技术方向）、核科学与技术基地班（放射化学方向）、物理学基地班、生物学基地班、生命科学与技术基地班、地理学基地班；

全部计划进校后面向新生选拔的“基地班”有4个：化学基地班、大气科学基地班、信息科学与技术基地班（计算机科学）、信息科学与技术基地班（通信工程）。