今后全省9所重点建设高校和一般建设高校均有清晰的发展定位。按照计划，福建省将把厦门大学建设成为世界知名高水平研究型大学，把华侨大学、福州大学、福建师范大学、福建农林大学、福建医科大学、福建中医学院建设成为教学研究型大学;把集美大学、漳州师范学院建设成为有博士学位授予权单位。

　　一般本科院校以培养应用型人才和开展科技应用研究为主。福建工程学院、闽江学院、泉州师范学院、莆田学院和仰恩大学等5所本科院校，争取在2012年前通过教育部本科教学工作水平评估。厦门理工学院、三明学院、龙岩学院、福建警察学院、武夷学院和闽南理工学院等6所本科院校，争取在2015年前通过教育部本科教学工作水平评估。

　　厦门大学嘉庚学院、华侨大学厦门工学院、福建师范大学协和学院、福建师范大学闽南科技学院、福建农林大学金山学院、福建农林大学东方学院、集美大学诚毅学院、福州大学至诚学院和福州大学阳光学院等9所独立学院要确保2013年前达到国家规定的办学要求，争取到2020年前均通过本科教学工作水平评估，要逐步建立与产业发展、市场需求相适应的人才培养结构，建设成为以培养应用型人才为主，具有鲜明办学特色的教学型大学。